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科学家利用核糖体标记研究神经感染

科学家通过转录组学研究小胶质细胞的功能。这种方法提供了有关细胞在健康和疾病状态下活跃基因的动态信息。为此,他们从组织中分离出单个细胞,然后使用荧光激活细胞分选 (FA) 富集选定的细胞类型。

然而,FA 方法并非没有问题:“我们能够证明分类的小胶质细胞表现出离体活化特征,” TWINCORE 实验感染研究所博士后、这项研究的第一作者 Felix Mulenge 博士说,该研究现已发表在《神经炎症杂志》上。

“这是因为细胞在分选过程中会遇到流体动力压力或创伤,从而改变小胶质细胞的转录组。所以我们从未见过真正处于静止状态的细胞。”

人们长期以来的担忧是,这种“虚假”特征是否是小胶质细胞所特有的,还是在外周免疫细胞中也普遍存在。研究人员在中枢神经系统细胞和其他类型细胞的公开数据中检测到了虚假特征。

他们开始怀疑这些研究报告的结果是否充分反映了所分析细胞的体内状态。“在这个‘大数据’时代,这种体外转录改变对许多研究构成了重大技术挑战,”Mulenge 说。

为了避免这种情况,穆伦格采用了一种替代方法,称为核糖体标记,简称 RiboTag。RiboTag 不是对细胞进行分类来检查 RNA 分子,而是使用一种特殊的方式标记小胶质细胞的核糖体,随后富集标记的核糖体,从而确定小胶质细胞的翻译谱。

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