随着癌细胞的进化,它们的许多基因变得过度活跃,而其他基因则被拒绝。这些遗传变化可以帮助肿瘤失去控制并变得更具侵略性,适应不断变化的条件,并最终导致肿瘤转移并扩散到身体的其他部位。
麻省理工学院和哈佛大学的研究人员现在已经绘制出一个额外的控制层来指导这种进化——“染色质”的一系列结构变化,“染色质”是构成细胞染色体的蛋白质、DNA 和 RNA 的混合物。在一项针对小鼠肺部肿瘤的研究中,研究人员确定了 11 种染色质状态,也称为表观基因组状态,癌细胞在变得更具攻击性时可以通过这些状态。
“这项工作提供了使用单细胞表观基因组数据全面表征调节癌症肿瘤进化的基因的首批例子之一,”麻省理工学院博士后和该研究的主要作者 Lindsay LaFave 说。
此外,研究人员表明,他们在更具侵袭性的肿瘤细胞状态中发现的一种关键分子也与人类更晚期的肺癌形式有关,可用作预测患者预后的生物标志物。
麻省理工学院科赫综合癌症研究所所长 Tyler Jacks 和哈佛大学干细胞和再生生物学助理教授 Jason Buenrostro 是该研究的资深作者,该研究今天发表在 Cancer Cell上。
表观基因组控制
虽然细胞的基因组包含其所有遗传物质,但表观基因组在决定哪些基因将被表达方面起着关键作用。每个细胞的基因组都有表观基因组修饰——附着在 DNA 上但不改变其序列的蛋白质和化合物。例如,这些修饰因细胞类型而异,会影响基因的可及性,并有助于使肺细胞不同于神经元。
表观基因组的变化也被认为会影响癌症的进展。在这项研究中,麻省理工学院/哈佛大学的团队着手分析小鼠肺部肿瘤发生时发生的表观基因组变化。他们研究了一种肺腺癌小鼠模型,该模型由两种特定的基因突变引起,并与人类肺部肿瘤的发展密切相关。